马涓的父亲马从政，中年未有子嗣，后纳一妾，马从政得知小妾是为安葬父母而卖身时，便送其回家，且不要一文身价银两。事后，马从政梦小妾之父前来致谢：“愿汝富贵，涓涓不绝。”后来，其妻怀孕，生下一子，马从政遂为之取名马涓。
　　马涓中状元后，被授签书雄武军节度判官。赴任通报时，自称状元马涓到。吕晋伯道：“状元者，及第未除也，即为判官，不可曰状元。”马涓拜谢，从其言语。从前，韩持国知颍州，时彦中状元后签判，每自称状元，韩持国怒道：“状元无官耶，自此呼时签判。”时彦终身记恨此事。此二事绝对相类似，但一记恨，一拜谢者，何也？盖韩持国厉声而斥，则招人恨；而吕晋伯平心以导，则令人悦。
　　马涓廷对之日，刘器之做详定官，马涓为其所取录。后刘器之居南京，马涓为少尹，每次拜见刘器之，从来不行门生之礼。刘器之心中不平，并以此事说与宾客，宾客们都讥讽马涓，马涓解释道：“不然，凡省闱解送皆有主文，故所取士称门生，若殿试则天子自为座主，岂可称门生于他乎？”宾客以此告诉刘器之，刘器之叹服其言，两人遂为至交。
　　马涓后因忤怒蔡京而被贬，崇宁二年（1103），列为元祐党人而被免官禁锢，永不任用。